Если контейнеры у обоих фонов имеют одинаковый размер, попробуй использовать свойство background-position с отступами сверху и слева - подставляй такие значения, чтобы фон с логотипом лег как нужно. Думаю, отступ слева нужно будет задавать в процентах, а сверху - в пикселях.