У меня сразу все синхронизировалось и никогда таких облаков на документах не было. Я считал что они все у меня на диске, место позволяло и позволяет. А вот после восстановления такая фигня теперь и ничего не меняется.
Так вы же сами сказали, что купили новый ssd и восстанавливаете из ТМ. Так что что всё будет теперь по новой и в полном объёме происходить... в том числе и синхронизация с iCloud.
Потом, когда всё синхронизируется, будут только происходитьсинхронизации изменений, а не полностью всё, что на новый диск надо синхронизировать...