Не то, чтобы они исчезнут из языка совсем, но их станут использовать ещё меньше. Это при том, что немало тех, кто знает R, но их не использует.
Мой коллега по работе квадратными скобками не пользуется, так как он учил сразу tidyverse. Мой друг-логист говорил, что их только tidy учили в универе на курсе по R.
Предполагаю, что из-за пайплайнов в Base R используемость
[ ]
упадёт, потому что пайпы банально читаются проще (для новичков, разумеется)