Size: a a a

2019 December 29

VP

Vasily Popkov in Science FYI
Paulina D
Т.е. сказать, что контроль с нулевой концентрацией в день ридаута -- это 100% клеток; найти долю клеток от этого контроля в каждой концентрации препарата; потом вычесть это дело из 100%, чтобы вместо viability получить ингибирование?
Ну типо.
источник

PD

Paulina D in Science FYI
Vasily Popkov
Ещё неплохо бы иметь отрицательный для 0. Хотя это не мтт а просто подсчёт...
отрицательный что для 0?
источник

VP

Vasily Popkov in Science FYI
Paulina D
отрицательный что для 0?
Ну там  спирта налить)
источник

PD

Paulina D in Science FYI
Vasily Popkov
Ну там  спирта налить)
в смысле, того, в чём лекарство было растворено? Налила, да)
источник

PD

Paulina D in Science FYI
@Litto_ral @PopkovVasily спасибо!
источник

L

Litto_ral in Science FYI
Paulina D
в смысле, того, в чём лекарство было растворено? Налила, да)
Нет, в смысле то, что точно убьет все клетки. Положительный контроль
источник

PD

Paulina D in Science FYI
Litto_ral
Нет, в смысле то, что точно убьет все клетки. Положительный контроль
о, я не знаю, что точно убьёт все клетки, это пациентские клетки
источник

O

Orodret in Science FYI
Paulina D
Т.е. сказать, что контроль с нулевой концентрацией в день ридаута -- это 100% клеток; найти долю клеток от этого контроля в каждой концентрации препарата; потом вычесть это дело из 100%, чтобы вместо viability получить ингибирование?
Вроде же обычно считается лд50. Это концентрация, которая убивает50% клеток. Вроде формулы для рассчета должны быть легко находимы.
источник

O

Orodret in Science FYI
Да, не обязательно экспериментально находить такую концентрацию
источник

O

Orodret in Science FYI
Paulina D
руками, в нойбауэровской камере (это было больно, да)
Есть тест с формазаном, он сильно проще, если вещество есть
источник

E

Ego te saluto in Science FYI
Paulina D
руками, в нойбауэровской камере (это было больно, да)
Вы тоже извращенка, да? :3
источник

d

djeppa in Science FYI
Я да
источник

PD

Paulina D in Science FYI
Orodret
Есть тест с формазаном, он сильно проще, если вещество есть
да, мне сегодня уже показали. 😒 После того, как я всё руками пересчитала.
Автоматический счётчик клеток у нас тоже есть, но в нашей лабе его не одобряют, мол, неточно считает
источник

PD

Paulina D in Science FYI
Ego te saluto
Вы тоже извращенка, да? :3
Выходит, что так
источник

DK

Dm Kz in Science FYI
Paulina D
Чуваки, я гуглю свой вопрос, но пока выгугливается медленно. Может, кто быстро тут сможет сказать.
Я нафигачила в лунки плашки одинаковое количество клеток. Добавила разные концентрации препарата, который должен клетки убивать. Через несколько дней посчитала клетки в каждой лунке. В лунках с нулевой концентрацией препарата -- больше клеток, чем было в начале. В лунках с максимальной концентрацией препарата сдохли не все клетки, но почти все. Хочу теперь построить кривую доза-эффект. Как мне посчитать проценты эффекта?
можно попробовать через цитометр прогнать если он есть, с одинаковым количеством полипропиленовых микрошариков для всех образцов
источник

DK

Dm Kz in Science FYI
автоматический счётчик (Луна II) у нас кстати тоже не в почете
источник

PD

Paulina D in Science FYI
Dm Kz
можно попробовать через цитометр прогнать если он есть, с одинаковым количеством полипропиленовых микрошариков для всех образцов
Да всё у нас есть.
Ок, учту на будущее, спасибо
источник

DN

Darya Nemirich in Science FYI
Dm Kz
можно попробовать через цитометр прогнать если он есть, с одинаковым количеством полипропиленовых микрошариков для всех образцов
С цитометром, например, не получится считать клетки с длинными отростками
источник

VP

Vasily Popkov in Science FYI
А реально кто-то считал? Параллельно глазами и счётчиком, чтобы были научные основания заставлять людей считать глазами
источник

G

German in Science FYI
Не знаю похожа ли ситуация, но чуваки которые гистологию раковых клеток смотрят, всегда руками смотрят
источник