Size: a a a

2020 February 26

G

German in Science FYI
источник

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI
Я использу depMix, он вроде работает и делает то, что нужно
источник

G

German in Science FYI
и он может зависимость наблюдений учесть?
источник

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI
Нет))00
Но видимо это лечится декомпозицией матрицы и HMM поверх этого
источник

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI
Сейчас буду курить что умные люди написали
источник

МК

Михаил К. in Science FYI
Sergey Kolchenko
Состояние q_t зависит только от состояния q_t-1, это предлположение остается, у меня есть проблема, y_k и y_g скореллированы в целом
А авторегрессионные модели не зайдут?
источник

G

German in Science FYI
Sergey Kolchenko
Нет))00
Но видимо это лечится декомпозицией матрицы и HMM поверх этого
вообще не уверен что это лечится декомпозицией но попробуй
источник

G

German in Science FYI
Михаил К.
А авторегрессионные модели не зайдут?
а там можно состояния вывести из них?
источник

G

German in Science FYI
мне кажется в простейшем виде (который я представляю) не прокатят
источник

МК

Михаил К. in Science FYI
Смотря, что там за бинарный вектор
источник

МК

Михаил К. in Science FYI
Упустил про вектор
источник

G

German in Science FYI
я честно плохо во временных рядах разбираюсь, для этого практика нужна, а где мне её взять =(
источник

МК

Михаил К. in Science FYI
А что за корреляция между бинарными векторами?
источник

L

Litto_ral in Science FYI
Alexandra D
Чатик, а скажите, пожалуйста, смотрите ли вы % гибели клеток окраской пропидием?
Да, типичное окрашивание, а сет АннексинV/PI типичный сет на некроз/апоптоз на FACSe
источник

AD

Alexandra D in Science FYI
Litto_ral
Да, типичное окрашивание, а сет АннексинV/PI типичный сет на некроз/апоптоз на FACSe
Про аннексин знаю. Мне интересно, публикуют ли в чистом виде картинки с % PI-positives
источник

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI
Михаил К.
А что за корреляция между бинарными векторами?
Короче это измерение экспрессии гена, то есть вектор - n измерений определенного гена в кластере клеток от single cell rna seq. Понятно, что если кластеры похожи, то и их экспрессия будет похожа
источник

G

German in Science FYI
Михаил К.
А что за корреляция между бинарными векторами?
я так понял что находясь в состоянии S_i у тебя наблюдаемое зависит от предыдущего (даже если ты остаешься в том же состоянии)
источник

SK

Sergey Kolchenko in Science FYI
German
я так понял что находясь в состоянии S_i у тебя наблюдаемое зависит от предыдущего (даже если ты остаешься в том же состоянии)
И да и нет
источник

G

German in Science FYI
Sergey Kolchenko
И да и нет
а в чем нет?
источник

МК

Михаил К. in Science FYI
German
я так понял что находясь в состоянии S_i у тебя наблюдаемое зависит от предыдущего (даже если ты остаешься в том же состоянии)
Вроде как если есть корреляция, должна быть регрессия?
источник