r
Вроде обычно даже короткие риды длиннее 99?
100 ?)
Size: a a a
2020 June 24
O
100 ?)
Чаще 150. Во всяком случае, я последнее время больше с такими работаю
DA
Как тогда (чисто физически) можно сепарировать риды, если они короче повторяющего в разных референсах 99-mer? Подозреваю, что никак
Ну в кракене все устроено примерно так - классифицируют все что получается а все что не получается "идет" наименьшему общему предку в таксономии. Далее если надо представленность листьев подсчитать мультимапперы делятся между листьями с использованием соотношения приложенного на уникальные куски.
AB
Выравнивание ридов на свои референсы, потом разделить .sam на части по тому, на какие референсы они (риды) попали
кракен делает это быстрее и изящнее)
AB
Ну в кракене все устроено примерно так - классифицируют все что получается а все что не получается "идет" наименьшему общему предку в таксономии. Далее если надо представленность листьев подсчитать мультимапперы делятся между листьями с использованием соотношения приложенного на уникальные куски.
еще кракен и центрифугу можно очень клево визуализировать павианом
r
метагеномщики
🌝
🌝
AB
метагеномщики
🌝
🌝
?
2020 June 25
r
понял, что в этой далекой от меня теме уже есть множество высокоуровневых решений )
AZ
@viktoria_korzhova я бы на твоем месте воздержался от поездок в Беларусь) https://naviny.by/article/20200624/1593008964-belorusam-zapretili-rasskazyvat-o-svoem-opyte-obucheniya-za-granicey
SK
Емое, реально?
SK
Как же надоели эти безумные деды
AA
Есть кто-нибудь, кто находятся на J и H1B в сша? Кто-нибудь разобрался в действии прокламации на простых смертных? У нас в онкоцентре сказали, что те, у кого уже есть виза, могут ее продлевать без проблем. И те, у кого J могут переходить на H1B. Прокламация касается только тех, кто первый раз будет подаваться. Но они как-то не очень в этом уверенны по-моему. Инересно, что об этом думают в других заведениях?
Наши прислали такое разъяснение. Видимо, статус (чтобы продолжить находиться в стране) продлят, а вот новую визу (чтобы можно было въехать) — не выдадут, даже если она "продолжает" старую.
Individuals currently inside the U.S. in H-1B status are not immediately impacted by this proclamation. This includes those seeking a change of non-immigrant status within the U.S.
Absent further guidance, H-1B-eligible individuals outside the U.S. but already holding a valid H-1B visa as of 6/24/20 should be able to use that visa to enter the U.S.
H-1B eligible individuals outside the U.S. and without a valid H-1B visa stamp are impacted, as visa issuance is suspended through December 31,2020. [Please contact us ASAP].
Exemptions or other options may be possible on a case-by-case basis.
This includes both NEW and CONTINUING employees.
Current H-1B employees inside the U.S. and whose H-1B approval status expires within 6 months, should work with his/her department to start the renewal process [...] immediately.
Individuals currently inside the U.S. in H-1B status are not immediately impacted by this proclamation. This includes those seeking a change of non-immigrant status within the U.S.
Absent further guidance, H-1B-eligible individuals outside the U.S. but already holding a valid H-1B visa as of 6/24/20 should be able to use that visa to enter the U.S.
H-1B eligible individuals outside the U.S. and without a valid H-1B visa stamp are impacted, as visa issuance is suspended through December 31,2020. [Please contact us ASAP].
Exemptions or other options may be possible on a case-by-case basis.
This includes both NEW and CONTINUING employees.
Current H-1B employees inside the U.S. and whose H-1B approval status expires within 6 months, should work with his/her department to start the renewal process [...] immediately.
СО
Наши прислали такое разъяснение. Видимо, статус (чтобы продолжить находиться в стране) продлят, а вот новую визу (чтобы можно было въехать) — не выдадут, даже если она "продолжает" старую.
Individuals currently inside the U.S. in H-1B status are not immediately impacted by this proclamation. This includes those seeking a change of non-immigrant status within the U.S.
Absent further guidance, H-1B-eligible individuals outside the U.S. but already holding a valid H-1B visa as of 6/24/20 should be able to use that visa to enter the U.S.
H-1B eligible individuals outside the U.S. and without a valid H-1B visa stamp are impacted, as visa issuance is suspended through December 31,2020. [Please contact us ASAP].
Exemptions or other options may be possible on a case-by-case basis.
This includes both NEW and CONTINUING employees.
Current H-1B employees inside the U.S. and whose H-1B approval status expires within 6 months, should work with his/her department to start the renewal process [...] immediately.
Individuals currently inside the U.S. in H-1B status are not immediately impacted by this proclamation. This includes those seeking a change of non-immigrant status within the U.S.
Absent further guidance, H-1B-eligible individuals outside the U.S. but already holding a valid H-1B visa as of 6/24/20 should be able to use that visa to enter the U.S.
H-1B eligible individuals outside the U.S. and without a valid H-1B visa stamp are impacted, as visa issuance is suspended through December 31,2020. [Please contact us ASAP].
Exemptions or other options may be possible on a case-by-case basis.
This includes both NEW and CONTINUING employees.
Current H-1B employees inside the U.S. and whose H-1B approval status expires within 6 months, should work with his/her department to start the renewal process [...] immediately.
Спасибо большое! Наши очень непонятно объяснили, просто переслали переписку с каким-то юристом, из которой толком ничего не ясно. Меня как раз и беспокоил вопрос, можно ли выезжать и въезжать, т.е. обновлять имеющуюся визу. У нас почему-то решили, что можно. Но из вашего сообщения очевидно, что нет. Для меня это очень важно, ещё раз большое спасибо!
AA
Спасибо большое! Наши очень непонятно объяснили, просто переслали переписку с каким-то юристом, из которой толком ничего не ясно. Меня как раз и беспокоил вопрос, можно ли выезжать и въезжать, т.е. обновлять имеющуюся визу. У нас почему-то решили, что можно. Но из вашего сообщения очевидно, что нет. Для меня это очень важно, ещё раз большое спасибо!
Я, если бы планировал тут оставаться, до конца года никуда бы не рыпался, даже с учётом того, что у меня попадающий под исключение J-1.
Даже если юристы могут хорошо обосновать свою позицию — в ней надо будет ещё убедить сотрудника консульства. И надеяться, что за время ожидания визы правила снова не поменяются.
Даже если юристы могут хорошо обосновать свою позицию — в ней надо будет ещё убедить сотрудника консульства. И надеяться, что за время ожидания визы правила снова не поменяются.
СО
Я, если бы планировал тут оставаться, до конца года никуда бы не рыпался, даже с учётом того, что у меня попадающий под исключение J-1.
Даже если юристы могут хорошо обосновать свою позицию — в ней надо будет ещё убедить сотрудника консульства. И надеяться, что за время ожидания визы правила снова не поменяются.
Даже если юристы могут хорошо обосновать свою позицию — в ней надо будет ещё убедить сотрудника консульства. И надеяться, что за время ожидания визы правила снова не поменяются.
Да, я такой же вывод сделала. И у меня J-1.
AP
В кракене я не справился с нормальным созданием кастомных файлов с описанием таксономии (а без нее ничего не работает). Если это типа state of the art и самый простой способ - буду еще копаться конечно.
Привет. Им всем нужна таксономия в результате, так что да, лучше всего сделать свою базу. Кракен2 + бракен это то, что я делал. Но базу я делал только апдейтнутый nt, скриптами
ИЭ
У делойт шикапный график про стоимость обучения. Лучшая линейная регрессия
ИК
А что по икс?