Я просто не очень понимаю концепцию работы с материалами, ибо в Юнити пока без проблем только bitmap простейший переносится. Нужно прям знать, какие материалы можно юзать, а какие нет или как Вы это делаете?
Смотря какой шейдер используется. В некоторых проектах можно юзать различные тяжелые шейдеры и внутрь можно залить все карты, а в некоторых все карты нужно объединить в диффуз. В вашем случае шейдер имеет значение?
Все зависит от проекта. Если четких указаний нет, то я бы использовала стандартный шейдер с подключением всех необходимых карт (все карты вручную надо подтянуть)