Я могу импортировать скелет вместе с мешем. Там каждый меш будет иметь уже SkinnedMeshRenderer. Там опять-таки указана всего одна кость на конкретный меш (хотя меш управляется двумя), и анимация работает корректно. Если я хочу как бы "вручную" собрать своего персонажа, то есть сам создаю пустой объект, кидаю ему компонент SkinnedMeshRenderer и заполняю нужными костями и мешем, то упираюсь в то, что не пойму как объяснить компоненту, что там несколько костей