это когда пользователь ее запустил (на телефоне) а потом закрыл, но некоторый код дальше продолжает работать
Я не уверен, что чисто средствами Unity3d это можно сделать. Исходя из архитектуры движка, у вас врятли получиться создать дочерний процесс живущий вне всего приложения.